Połączenia na trasie Gdańsk Wrzeszcz – Malbork obsługuje m. in. IC. Pierwszy pociąg wyrusza o godzinie 01:28 z dworca Gdańsk Wrzeszcz. Ostatni pociąg do Malbork wyrusza o godzinie 23:43. Najszybszy przejazd oferuje pociąg EIP 5306/7. Podróż tym pociągiem trwa 00:32. Na trasie Gdańsk Wrzeszcz – Malbork kursują również inne pociągi: EIP, TLK, EIC - oferują niższą cenę biletu i zazwyczaj dłuższy czas podróży. Pociąg kończy bieg na stacji Malbork.